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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T神经元要能判别肿癌神经元接触面的注意组建相匹配性挽回体(MHC)呈递的抗原而勾起免役检测性体现。MHC I类(MHC-I)大氧氧分子与CD8+ T神经元共同帮助,其呈递的肽注意源于于内源性胞质淀粉酶的淀粉酶酶体溶解,而MHC II类(MHC-II)大氧氧分子注意把你想表达出来于正规抗原提呈神经元,与CD4+ T神经元共同帮助,其呈递的肽源于凭借内体条件溶解的胞外和胞内淀粉酶(图1)。因为,判别由MHC大氧氧分子呈递的肿癌抗原谈谈构思依赖于T神经元判别和杀灭肿癌神经元的高效和安全卫生的癌症复发免役检测性治疗方案是至关决定性的。因为质谱(MS)的免役检测性肽组学(Immunopeptidomics)要能从很多神经元系、肿癌组建和安全健康组建中高通芯片量、同时检验MHC配合肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC表面抗原含有MHC和其组合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫细胞肽字段并且 译为后表达内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo从后测序技术设备,不依赖现有数据库,更快通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多的数据文件概述信息为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递淋巴肿瘤抗原的方法

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

NO.1 进行实验工艺流程

NO.2 护肤品特征

NO.3 定量分析内部(部门)

NO.4 送样意见和建议

事例探讨

01 制度研究探讨

论文小题目:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

文章发表刊物:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核输出电压蛋白质,在癌症晚期中时不时过表示,做以为肉瘤情况的动力重要因素。现阶段,靶向治疗药物XPO1的小氧分子正被看做监床治癌治疗药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 的起源XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肉瘤-免疫力改善

新闻稿件考题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

刊登杂质:Nature Communications IF:16.6 2023

恶意胸膜间皮瘤(MPM)一种效果黑心的外侵性恶性肿瘤。由涉及的的中药治愈方式较弱的作用,所以迫切须要须要新的的中药治愈策咯。由此可见其T上皮细胞浸润性,小说作者选用MPM一个好的的中药治愈性癌症复发预防针的要求。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用应用于质谱的免疫抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶变胸膜间皮瘤天然免疫肽组学验测

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 大肠杆菌mRNA预防针开发建设

文章内容之类:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

提出期刊杂志:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过研究背景质谱的免疫系统肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌感染支原体的Hela細胞和HCT-116細胞中鉴定结论MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱工作小结

天然抗体体系抗体肽组学是淀粉酶质组学的一些迅速转型的结点,它精益求精于设计天然抗体体系抗体体系中由最主要的组织开展化相溶性软型体(MHC)或人类白血球系抗原(HLA)团伙呈递的天然抗体体系抗体肽。这天然抗体体系抗体肽是神经元系外壁呈递的肽段,要能被T神经元系认别,关键在于激发天然抗体体系抗体响应。立于质谱的天然抗体体系抗体肽组学都已经称得上监定MHC淀粉酶呈递肽的金标淮的办法,要能一直监定其他生物学和方面的问题工作状态下其他组织开展化和神经元系款式中的天然抗体体系抗体肽组,列如 物理瘤或细菌病毒性感染的神经元系。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的血清组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫性肽组探测精准服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,能够更准确且真接展示 免役系统肽编码序列,会发现更高非基本特征免役系统肽,逐层筛分出不靠谱新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

参照期刊论文

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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