鸡肉是生活上消耗很广泛的冷冻食品之1，鸡肉产品品质影响消耗者购得决策分析。屠宰场后肌肤组建細胞现在开始经过多重模式的枯死视频，如受损神经细胞坏死、凋亡、焦亡和自噬，就是肌肤转成为肉的首先步，哪一步骤可能会会导致一系列的繁杂的生化模式表现。铁枯死视频是比较近在保鲜鸡肉中发展的一个細胞枯死视频步骤，其介导的蛋白质氧化反应和細胞枯死视频可能会会大幅度降低肌肤产品品质，但其长效机制尚不明白。

2023年9月26日，宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry（IF=8.8）上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外，化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析，发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。

文章标题公司名称：TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration（FOOD CHEM.，IF=8.8，2023.09） 的客户部门：青海一本大学 研究方案材质：牛肉片 分组进行数据：有差异 冷藏库时期的机器设备肌团队 拜谱带来了枝术：TMT核营养物质组学

PART 01

探究成果

调查人科学探究伴随着保鲜冷库库周期段延迟鸡肉的洛氏洛氏硬度、持混流式水轮机、光色、自由铁的含量的、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4技术来评定脂肪进行血人体细胞的铁牺牲的情形。效果屏幕上显示，保鲜冷库库周期段延迟后，鸡肉的洛氏洛氏硬度在第3天和第6天强势走低；持水功能降低了；红颜色变深，失掉光泽度，鲜色成为暗色。于此，自由铁、化学活化氧和MDA的的含量的强势提高，血人体细胞凋亡率强势增加。 研究方案人士分离出各不相同速冻时长的肌群样机英文的淀粉酶酶质，之后对其进行SDS-PAGE剖析，淀粉酶酶质条带在各不相同五代十国时期占比平均且相同（图1a）。表明淀粉酶酶在各不相同样机英文中的展现情况发生，剖析感觉一个组样机英文的中个数相当于一个横向（图1b），就说明肌群样机英文淀粉酶酶质更具良好的的组内相同性和组间异同性。 血清质组学共判定费出1996种血清质。以B0为對照组，淘汰B1、B2、B4和B6中的血清去差别传达进行定性分析，共判定费到374个DEPs。将火山图可视化管理，并通过FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两人规则进行定性分析DEP。最后如下图1c-f已知，在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别判定费出22、33、73和140个DEPs，这里面分发型别上浮6、11、32和86个，降低16、22、41和52。聚类分析办法开展了不同于保温第一阶段力量团体中血清质的传达，最后表现力量血清传达差别随之存贮时段的延长而延长（图1g）。

图1| 多种冷藏箱耗时的腿部肌肉样本核蛋白组学(图源：Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)

继而论述师对差别血清质采取微动事物信息查询学定量分析，GO用语可分为微动事物操作具体步骤（BP）、大分子结构能力表(MF)和体组织面神经体细胞化学物质(CC)。下图2如图所示，BP组的DEPs注意的参与活动者活动体组织面神经体细胞操作具体步骤(148)、分解操作具体步骤(116)、微动事物的设定(78)、微动事物操作具体步骤的设定(74)和对影响的反應(57)。MF组的DEPs注意的参与活动者活动组合(114)、催化反应化学活化(75)等。CC组的DEPs注意的密切相关体组织面神经体细胞剖解片体(171)和含血清质复合型物(56)等。考虑到在大分子结构质量上相一致DEPs在体组织面神经体细胞和微动事物体中的能力表和信号通道，论述师将DEPs丰度的KEGG信号通道采取参考文献标注和监定。图2b展现了前20个丰度信号通道，涉及铁阵亡、亨廷顿病、肌回缩性侧索软化症、面神经转化-多发病性传染性传染病信号通道、碳分解、檸檬酸循坏(TCA循坏)和氧化物磷硝化作用。在这其中，参与活动者活动铁阵亡方式的DEPs有1几个。 以便进一大步打磨与铁身故涉及的径路主动用，对签定的1五个DEPs做了KEGG径路剖析。进入铁身故的前20条涉及途经（图2c）一般包涵组织期间、条件相关信息操作、排泄和零件模式。铁身故是组织早衰和自杀的很重要期间。里面34个对比展现的球核蛋白质进入了总计有38条途经（图2d）。球核蛋白质主动用剖析揭示，除VDAC3和PRNP外，大多数球核蛋白质主动用可以调节铁身故（图2e）。对已签定的与铁垂下去关与的的DEPs做亚组织准确定位剖析，发现了与铁身故关与的的排泄期间一般产生在组织质、内质网、线粒体、膜、高尔基体和组织外区（图2f和g）。

图2| 各不相同冷藏库精力的肌肉组织样品英文差异性血清浅析(图源：Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)

钻研员基于TMT参考值淀粉酶质组学研究的但是，决定14个参加铁死忙调空的淀粉酶采取PRM参考值认可。如表1如下图所示，每台淀粉酶每组所含一惟一性肽段，会因为淀粉酶的一模一样性和丰度让，根据PRM用的目标肽情节的参考值数据源采取认可。的但是挖掘与TMT参考值淀粉酶检验是一样的，参加铁死忙路线的15种淀粉酶的阳离子丰度影响趋向是一样的，有8种DEPs调整，7种DEPs上涨。

表1 铁突然死亡血清肽的PRM化学发光法深入分析(表源：Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)

总的言之，铁淀粉酶总体关卡的变动（图3）表述它在制冷剂全阶段中被生物光降解了。HMOX1的上涨表述在保温全阶段中發生了赤红素生物光降解。PCBP2总体关卡的降底阻止了FPN介导的 Fe2+易位全阶段。除外，转换到血神经元外腔室的 Fe2+在铜蓝藻的角色下发展转变成为 Fe3+，与转铁淀粉酶相紧密联系的 Fe3+实现TBITFR1混合物转换到血神经元内腔室，应该导至血神经元内PCBP1/2总体关卡的降底。PCBP1和PCBP2淀粉酶表述总体关卡降底，表述与 Fe2+大生物大分子的相紧密联系全阶段减少，这也增进了 Fe2 +在血神经元内的累积。GSH总体关卡变动表述GPX4性能骤降，应该导至铁自杀者全阶段激发，并且ROS总体关卡为显著增大，ROS总体关卡增大提醒胸肌团队抗阳极被氧化物的能力素质骤降，胸肌团队阳极被氧化物的激发。CSL4和LPCAT3淀粉酶总体关卡增大，表述AA前提条件被刺激，脂质过阳极被氧化物的乙酰乙酸丙二醛总体关卡增大。脂质是胸肌的极为重要组建一部分，也是胸肌软件中药剂学机械性质最不动态平衡的含量产品之一，铁自杀者前提条件实现血神经元膜阳极被氧化物的介导血神经元自杀者。

图3| 基本概念KEGG聚集相互影响形容淀粉酶的铁死掉规则(图源：Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202

PART 02、拜谱总结ppt

作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs，包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外，通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析，发现了37条代谢途径，通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角，可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱怪物提供了TMT酶联免疫法蛋清质组学技術功能，拜谱生物技木已研发团队来完成并确立了健全成孰的转录组学、蛋清组学、消化吸收组学已经几组学联办產品技術功能管理体系，欢迎致电咨询！

选取论文参考文献：Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.